26 мая 1982 года в столице был открыт один из знаковых музеев – музей истории Киева. Открытие приурочили 1500-летию основания города.
Музей разместили в помещении Кловского дворца - памятника зодчества, построенного в 1752-1756 годах архитекторами Шеделем и Нееловым.
За время существования музея его посетили более 10 млн киевлян и гостей города.
Музеем были открыты филиалы:
- Музей культурного наследия на ул. Кловской, 40б;
- Киевский музей Пушкина на Кудрявской, 9;
- Музей Булгакова на Андреевском спуске;
- Музей Шолом-Алейхема на Большой Васильковской, 5;
- Музей шестидесятников на ул. Гончара, 33;
- Музей Грушевского на ул. Паньковской, 9.
- Многие филиалы требуют ремонта и реставрации.
9 марта 2004 года экспозиция в Кловском дворце была закрыта. Ее сложили вместе со всеми музейными фондами в две тысячи деревянных ящиков и «переместили» на четвертый и часть пятого этажа Украинского дома. Там уникальные свидетельства истории Киева (теперь это около 300 тыс. экспонатов) хранились, как утверждают некоторые эксперты, в недопустимых условиях. А помещения Кловского дворца передали в пользование Верховному Суду Украины
В августе 2011 года руководство КГГА обнародовало планы по размещению Музея истории Киева в здании торгово-офисного центра, по адресу ул. Б. Хмельницкого, 7.
Открытие музея в новом помещении состоялось 27 мая 2012 года.